流式細胞儀閾值：

流式細胞術中的閾值（threshold）實際上定義了一個障礙，或者一個極限。只有大于閾值的信號才能被記錄下來。如果在前向散射光通道設定閾值，就是說細胞的前向散射光信號必須比設定的閾值更大才能被流式細胞儀記錄，否則這個信號將會丟失。設定合理的閾值，可以避免塵粒、碎片和電子噪音的干擾，又可保證樣品的信號完全被檢測、不丟失。如果閾值設定太高，可能丟失重要信息；反之，閾值太低，各種噪音將影響樣品的準確測定。

流式細胞儀通道：

從光電檢測器輸出的電子信號是經過放大的，經過分析得到它的強度數值，這個數值通過模擬數字轉換器( analog -to-digital converter, 簡稱ADC )記錄下來，ADC的作用是把連續分布的信號按不連續的范圍進行分組，并把分成的各組以數據形式儲存起來。連續的信號被ADC分成不連續的數據通道（channel）,通道個數通常是1024個（也可以是256或65536個）。一個通道代表某一特定光強度的范圍。信號的通道數越大，所代表的信號強度就越大；通道數越小，則信號強度越小。